*Stasiun Gambir:*
- KA Argo Bromo Anggrek Relasi Gambir-Surabaya Turi
- KA Argo Lawu Relasi Gambir-Solo
- KA Argo Dwipangga Relasi Gambir-Surabaya Turi
- KA Argo Sindoro Relasi Gambir-Semarang Tawang
- KA Argo Muria Relasi Gambir-Semarang Tawang
- KA Argo Cheribon Relasi Gambir-Cirebon
- KA Argo Parahyangan Relasi Gambir-Bandung
- KA Gajayana Relasi Gambir-Malang
- KA Brawijaya Relasi Gambir-Semarang Tawang-Malang
- KA Bima Relasi Gambir-Surabaya Gubeng
- KA Sembrani Relasi Gambir-Surabaya Turi
- KA Taksaka Relasi Gambir-Yogyakarta
- KA Purwojaya Relasi Gambir-Cilacap
- KA Argo Sindoro Relasi Gambir-Semarang Tawang
*Stasiun Pasar Senen:*
- KA Singasari Relasi Pasarsenen-Blitar
- KA Gaya Baru Malam Selatan Relasi Pasarsenen-Surabaya Gubeng
- KA Jayabaya Relasi Pasarsenen-Surabaya Turi
- KA Brantas Relasi Pasarsenen-Blitar
- KA Bangunkarta Relasi Pasarsenen-Jombang
- KA Gumarang Relasi Pasarsenen-Surabaya Turi
- KA Dharmawangsa Ekspres Relasi Pasarsenen-Surabaya Turi
- KA Fajar Utama Solo Relasi Pasarsenen-Solo Balapan
- KA Mataram Relasi Pasarsenen-Solo Balapan
- KA Fajar Utama YK Relasi Pasarsenen-Yogyakarta
- KA Sawunggalih Relasi Pasarsenen-Kutoarjo
- KA Jayakarta Relasi Pasarsenen-Surabaya Gubeng
- KA Kertajaya Relasi Pasarsenen-Surabaya Turi
- KA Matarmaja Relasi Pasarsenen-Malang
- KA Progo Relasi Pasarsenen-Lempuyangan
- KA Bengawan Relasi Pasarsenen-Purwosari
- KA Serayu Relasi Pasarsenen-Purwokerto
- KA Airlangga Relasi Pasarsenen-Surabaya Turi
- KA Bogowonto Relasi Pasarsenen-Lempuyangan
- KA Gajahwong Relasi Pasarsenen-Lempuyangan
Stasiun Jakarta Kota:
- KA Kutojaya Utara Relasi Jakarta Kota-Pasarsenen-Kutoarjo
(IND)