Donny memastikan pengelolaan URI akan tetap bersinergi dengan Kementerian Pendidikan Tinggi, Sains, dan Teknologi (Kemendiktisaintek) serta Kementerian Pendidikan Dasar dan Menengah (Kemendikdasmen).
"Saat ini yang melaksanakan, yang mengelola sekolah unggulan dan yang melaksanakan perguruan tinggi itu adalah di Kementerian Dikti. Nah nanti akan kita kelola supaya Kementerian Dikti juga bisa melaksanakan tugas fungsinya sesuai dengan ketentuan ya," ujar dia.
Untuk kampus permanen, pemerintah telah menyiapkan lahan di kawasan Cikasungka, Bogor Utara. Lahan tersebut merupakan bekas perkebunan sawit milik PTPN yang akan dialihfungsikan menjadi kawasan URI.
Sementara itu, operasional awal URI akan menggunakan gedung sementara di kawasan Jalan Merdeka Selatan, Jakarta, dengan memanfaatkan dua lantai gedung milik BUMN.