Sebagai fasilitas ramah lingkungan, Marunda Flow Center dibangun menggunakan material lokal dan dilengkapi panel surya yang memenuhi kebutuhan listrik operasional. Atap transparan dimanfaatkan untuk pencahayaan alami, sementara sistem HVAC otomatis diterapkan untuk efisiensi energi dan kenyamanan lingkungan kerja.
Tak hanya itu, fasilitas ini juga mengadopsi teknologi otomatisasi mutakhir, termasuk pemindai gantry untuk pencatatan berat dan dimensi kargo secara real-time, serta sistem pemindai PO untuk mendeteksi dan mengeliminasi kesalahan pengiriman.