Bendungan Bener bersifat multifungsi karena memiliki banyak manfaat. Misalnya, mendukung ketahanan pangan dan air di Jawa Tengah.
Keberadaan Bendungan Bener akan meningkatkan produktivitas pertanian lantaran dapat mengairi lahan irigasi seluas 15.519 hektare (ha) di Kabupaten Purworejo, lalu mampu menampung air hingga 92 juta meter kubik (m3).
"Manfaat lainnya yakni dapat menyuplai air baku untuk keperluan rumah tangga, kota, dan industri sebesar 1.500 liter per detik ke Kabupaten Purworejo, Kebumen, serta Kulon Progo, termasuk Bandara YIA," kata dia.
Bendungan Bener berpotensi menyuplai energi listrik sebesar 10 Megawatt (Mw). Bahkan mampu mencegah banjir di sekitar bendungan. PSN tersebut mampu mereduksi debit banjir dari 583,94 m3 per detik menjadi 178 m3 per detik atau 70 persen pada debit banjir per 25 tahun (Q25).