Soal performa, kriteria mesin yang digunakan tak ada bedanya dengan generasi pertama. Termasuk tenaga yang dihasilkan juga sama dengan generasi sebelumnya.
- Generasi Ketiga (2012-2015)
Generasi ketiga baru muncul pada tahun 2012-an. Dinamai dengan Vario 125 FI, mesin dan tampilannya sama-sama mendapatkan penyegaran dari generasi kedua. Pada bagian mesin, Honda menyematkan sistem pengabutan Programmable-Fuel Injection (PGM-FI).
Dilansir dari situs resmi Astra Honda, teknologi PGM-FI mampu membuat motor jadi lebih ramah lingkungan karena menekan emisi hingga 90%, irit bahan bakar, akselerasi lebih bertenaga dan responsif, serta menjadikan mesin mudah dirawat.
Sedangkan di sisi lain kapasitas mesin Vario generasi ketiga ini juga ikut ditingkatkan menjadi 125 CC. Disokong oleh PGM-FI + 4-langkah SOHC dengan 2 katup, tenaga maksimal yang dihasilkan adalah 11,3 PS @ 8.500 rpm.
- Generasi Keempat (2015-Sekarang)
Generasi yang paling baru adalah generasi keempat. Mulai tahun 2015, Astra Honda Motor kembali menelurkan varian baru yaitu Honda Vario 110 eSP, Honda Vario 125 eSP, dan Honda Vario 150 eSP.