Barulah pada 1969 Ajinomoto beroperasi di Indonesia dengan membuka PT Ajinomoto Indonesia. Tak lama kemudian Ajinomoto mendirikan pabrik pertamanya di Indonesia di Mojokerto, Jawa Tengah.
Pada periode 1987-199, Ajinomoto memproduksi bumbu masak bernama Masako, dan tahun-tahun berikutnya perusahaan ini meluncurkan produk-produk bumbu dapur lainnya yang kini dikenal luas masyarakat.
Beberapa merek produk yang dibuat Ajinomoto Indonesia selain Masako antara lain Saori Saus Tiram, Sajiku Tepung Bumbu, dan mayonaisse Mayumi. Selain memproduksi bumbu untuk dijual ke konsumen langsung, Ajinomoto juga menjual bumbu untuk industri.
Saat ini Ajinomoto Indonesia masih menjadi bagian dari Global Ajinomoto Group. Perusahaan ini memiliki dua pabrik sejak pendiriannya, satu di Mojokerto dan satu lagi di Karawang. Sekarang Ajinomoto Indonesia terdiri dari sejumlah anak perusahaan.
Yakni PT Ajinomoto Indonesia, PT Ajinomoto Sales Indonesia, dan PT Ajinex International. Jadi pemilik Ajinomoto saat ini masih perusahaan induknya, yakni Global Ajinomoto Group. Di negara lain, Ajinomoto juga memproduksi bumbu masak dengan merek khas masing-masing.