Adapun saat ini Perusahaan mengoperasikan 6 kapal Penumpang, yakni KM Bukit Siguntang dengan rute Makassar - Pare-Pare - Balikpapan - Tarakan - Nunukan - Balikpapan - Pare-Pare - Makassar - Larantuka - Kupang (PP); KM Labobar: Bitung - Ternate - Sorong - Manokwari - Serui - Jayapura - Serui - Manokwari - Sorong - Ternate - Bitung - Pantoloan - Balikpapan - Surabaya; KM Dobonsolo: (Tg. Priok - Surabaya - Makassar - BauBau - Ambon - Sorong - Serui -Jayapura (PP).
Selain itu terdapat KM Gunung Dempo: Tg. Priok - Surabaya - Makassar - Sorong - Manokwari - Wasior - Jayapura -Manokwari - Sorong - Namlea - Makassar - Surabaya - Tg. Priok; KM Dorolonda: Tg. Priok - Surabaya - Makassar - BauBau - Namlea - Ambon - Ternate - Bitung (PP).
Kemudian KM Kelimutu: Semarang - Sampit - Surabaya - Kumai - Surabaya - Sampit - Semarang - Kumai - Semarang - Karimun Jawa - Semarang - Sampit - Surabaya.
"Pada pelayaran KM Kelimutu Minggu kemarin (5/7), kapal membawa 239 penumpang dari Pelabuhan Tanjung Emas Semarang, dimana 237 penumpang turun di Pelabuhan Sampit," ungkap Yahya.
Dari Larantuka, NTT Untuk pelayaran perdana dengan KM Bukit Siguntang, penumpang tujuan Makassar - Parepare - Balikpapan - Tarakan - Nunukan sebanyak 198 Orang. "Pemda Flores menggratiskan pemeriksaan Rapid Test untuk pelajar dan mahasiswa. Ini bukti dukungan baik dari Pemerintah Daerah untuk pelayanan masyarakat pengguna kapal PELNI," tambahnya.