Berdasarkan Perpres tersebut pengaturan desain arsitektural bangunan di KIPP mengacu kepada keselarasan lingkungan dan aspek budaya lokalitas Nusantara, serta didasarkan kepada konsep arsitektur Nusantara.
"Prinsip arsitekturnya Nusantara dan arsitektur tropis,” sambung Hayu.
Pembangunan IKN Nusantara juga dicita-citakan untuk mengembalikan fungsi hutan tropis di Kalimantan Timur, yang mana selama ini hanya menjadi hutan produksi dengan tanaman monokultur.