Para penumpang dijamin akan merasa nyaman, sebab bangunan stasiun dilengkapi bukaan puncak atap. Hal itu sengaja didesain agar sirkulasi udara berjalan lancar.
Selama berdiri, Stasiun Bogor pernah beberapa kali mengalami banjir, seperti di tahun 2013, 2014, dan 2021. Akibatnya, jadwal perjalanan KRL terganggu dan banyak penumpang harus mengalami keterlambatan.
(DES)